产品问题分析

产品问题分析

基因组DNA提取常见问题分析

发布者:博迈德生物2018-06-192410

1、未提取到DNA

原因分析:漂洗液中忘记加无水乙醇

建议解决方案:第一次实验时,在漂洗液WB中加入指定量无水乙醇。


2、血液标本中含有血凝块

原因分析:不恰当的存放标本,未充分混匀,未使用合适的抗凝收集管

建议解决方案:丢弃有血凝块的标本,重新用EDTA、肝素、柠檬酸抗凝管收集血液。


3、红细胞裂解不完全

原因分析:血液标本裂解前没有恢复到室温

建议解决方案:处理前先把血液标本恢复到室温。

原因分析:裂解时间不够

建议解决方案:可延长裂解时间至15分钟以上。

原因分析:裂解过程中没有多次混匀

建议解决方案:裂解过程中可以更多次颠倒混匀,或者轻弹管壁帮助裂解。


4、DNA产量低

原因分析:血液标本中含有白细胞数量低

建议解决方案:增加起始血液处理量。

原因分析:裂解不完全

建议解决方案:加裂解液前打散细胞团;适当增加裂解液体积;使用配套的裂解液。

原因分析:样品存放的时间太长

建议解决方案:尽量使用新鲜样品;

原因分析:组织块太大,蛋白酶K消化不完全

建议解决方案:液氮研磨、将组织切成小块,或者延长蛋白酶K消化时间

原因分析:和异丙醇没有充分混匀

建议解决方案:加入异丙醇后,和裂解物混匀后才加入吸附柱。

原因分析:洗脱效率不高

建议解决方案:使指定配套的洗脱缓冲液EB洗脱。

原因分析:蛋白酶K失效

建议解决方案:收到蛋白酶K后,按照每次使用量分装冻存,避免反复冻融。

原因分析:DNA沉淀在洗涤时丢失

建议解决方案:异丙醇沉淀后用乙醇洗涤的过程中,倒弃上清的时候要格外小心。

原因分析:使用水或者其它非最佳液体洗脱

建议解决方案:使用配套的洗脱缓冲液

原因分析:试剂盒储存在非最佳条件

建议解决方案:收到试剂盒后总是存放在室温(15℃-20℃)。

原因分析:样品处理困难

建议解决方案:尽量将材料研磨细,匀浆完全。


5、DNA长度小于20kb

原因分析:DNA降解,样品存放太久或者未正确存放

建议解决方案:选用新鲜样品。

原因分析:操作不当,造成对基因组DNA的剪切

建议解决方案:混匀轻柔,不可以用手剧烈振荡离心管,选用大口径的吸头转移或者混匀DNA。


6、A260/A280<1.6

原因分析:有蛋白质污染

建议解决方案:保证重复的裂解液用量和时间,确保蛋白通过沉淀去除。

原因分析:测定吸光值时用水稀释DNA

建议解决方案:使用TE缓冲液来稀释DNA,保证pH值大于8.0。

原因分析:DNA没有完全溶解

建议解决方案:重新溶解DNA。


7、A260/A280>1.9

原因分析:RNA酶处理时间不够

建议解决方案:加大RNA酶用量或者处理时间延长。

原因分析:DNA剪断

建议解决方案:严格按照操作步骤,动作不可以太剧烈。


8、未见到蛋白沉淀

原因分析:加入蛋白沉淀液前,裂解混合物没有冷却至室温

建议解决方案:冷却至室温或者冰上放置5分钟后再加入蛋白沉淀液。

原因分析:蛋白沉淀液未与裂解混合物充分混匀

建议解决方案:应该连续高速涡旋振荡混匀25秒。


9、下游酶切切不开

原因分析:DNA未干燥完全,残留乙醇太多

建议解决方案:敞开离心管口,在65℃温育几分钟,让乙醇挥发。

原因分析:硅基质膜成分一起洗脱下来

建议解决方案:将洗脱的基因组DNA溶液13,000rpm再离心一分钟,小心取上清使用。


10、PCR反应受抑制

原因分析:BSA没有加到PCR反应体系

建议解决方案:PCR反应体系中加入终浓度0.1μg/μl的BSA。

原因分析:非特异性扩增条带

建议解决方案:洗脱液中目的DNA量太低,背景DNA过高,建议使用热启动PCR聚合酶。


11、离心柱堵塞

原因分析:裂解物太粘稠

建议解决方案:减低起始材料量,不要处理过量。

原因分析:离心力太小

建议解决方案:加大离心力。


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