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细菌16S菌种鉴定

细菌16S菌种鉴定

发布者:博迈德生物2018-01-162143


产品介绍

    方便、快捷地完成各种细菌的分子生物学鉴定。独特的实验方法,有效避免了污染,帮助您获得真实、可信的结果。细菌16S rDNA菌种鉴定 细菌的rRNA有5S,16S,23S三种。其中5S rRNA信息量少,不适合分析,而23S rRNA分子量大,但碱基突变速率要比16S rRNA快得多,对于较远的亲缘关系不适用。16S rRNA其大小在1500bp左右,所代表的信息量适中,因此是进行分类研究的理想材料。我们使用博迈德——细菌基因组DNA快速提取试剂盒(DN11)进行实验。利用16S rDNA两端的引物PCR扩增未知菌株的16S rRNA基因,并进行DNA测序,与GenBank中的已知序列进行同源性比较后,判定细菌种类,将细菌划分到属或种。 

服务内容

    1. 细菌16S rDNA部分序列解析

    2. 扩增细菌16S rRNA的全长序列,只使用Seqforward引物进行一个测序反应(有效序列约800bp),即可得到含有部分种属特异性的16S信息,是一种较为经济便捷的鉴定方法。

    3. 细菌16S rDNA全序列解析

    4. 扩增细菌16S rRNA的全长序列,约1500bp左右,需进行两个测序反应,并进行拼接处理,以得到较为全面的种属特异性信息。


服务说明

    1. 我们目前接收的样品形式为:基因组DNA、经菌种分离后带有单菌落的新鲜平板或斜面以及细菌悬浮液。

    2. 基因组DNA的浓度不低于10ng/μl,总体积不少于20μl,且无明显降解。平板或斜面应长有分离纯化的单菌落。菌悬液单一。

    3. 由于革兰氏阳性细菌的细胞壁较厚,采用试剂盒常规方法较难破壁,建议您提供基因组DNA(为了保证扩增质量,建议您提取后做一次乙醇沉淀以去除残存的盐离子等可能抑制PCR反应的成份)。

    4. 对于特殊菌株(如厌氧菌、放线菌等),请在服务委托书中加以说明。

    5. 常温运输时间过长会导致菌体老化,细胞壁难以破碎,因此对于平板或斜面,建议您使用冰袋运输。

    6. 如果测序结果出现如下套峰,视为样品不纯,本公司将收取全额实验费用。




    7. 如果测序结果出现如下两种情况,视为样品rDNA具有多态性。第一种情况对菌种鉴定的影响不大,视为正常;如果出现第二种情况,通常需要通过加测反应才能得到有效数据。


    第一种

    

第二种


    

注:以上实验费用及周期是针对正常实验样品制定的,样品特殊或样品多时除外。


提供结果

    详细实验报告、测序彩色波形图、序列文本、拼接序列。